纯乙炔是一种微毒素，具有很低的麻醉和防止细胞氧化的作用。

在较高浓度下，空气中的氧气被排出，导致简单的窒息。乙炔通常与磷化氢、硫化氢和其他气体混合，因此通常与这些有毒物质的毒性作用有关。人类暴露于100 mg/m3空气中可耐受30-60分钟，20%导致严重缺氧，30%导致共济失调，35%导致意识丧失5分钟，10%的乙炔在空气中停留5小时，导致轻度中毒。

动物长时间吸入非致死浓度的产品，导致血红蛋白、网织红细胞、淋巴细胞增加，中性粒细胞减少。尸检发现支气管炎、肺炎、肺水肿、肝充血和脂肪浸润。